理学笼罩下的经学

经学是两汉以下知识分子为学的基础，也是儒学研习的主要内容。元代因朱子学为主流，四书驾凌经学成为新宠，但经学仍是传统修习的要务，然而历代至今对元代经学的评价不高也未加注意，主要是因经学多依程朱之学加以阐发、补述，似无高见创新之故，因此研究甚少，还不能知道究竟。又因元代时间较短，加上著作流传也较少，缺乏详情难以讨论。元代经学大体上是守师传、阐明心得，并非全因袭程朱之说而不移，除多数程朱学派的大儒之外，仍有些独立的经学大师，如黄泽通五经，考论精审；俞琰博学，通古今注疏；吴澄博通诸经，调和朱陆。

北族研习儒学者不在少数，以经学成就称著的则少见，如女真族纥石烈希元、西域人余阙都曾对《易》著说；蒙古人保八有四五种《易》学作品；阿拉伯人赡思，博学通经，对《四书》、《五经》、《老庄》都有论著，而专长于《易》学。另外有脱脱、不里牙敦二人对《太常礼》的著述。文学家贯云石有为小皇子教学《孝经》的注释本，他说孝的基础是“爱”，而孝顺的“顺”不是顺从、顺服之意，应是指“和顺”的家庭关系，这确实和汉人传统的观念有所不同。

天文和农医之学

传统的学术及图书分类概略分为经、史、子、集四部。经部即由五经到十三经，也是儒学的根基；集部可看作文学类；史部为历史、地理、制度等；子部是诸子百家各种，佛、道的教门人物是主要代表，其他各别专门之学如医学、艺术、科技等都归属于子部之学。郭守敬是著名的元代天文学家，曾任职掌管天文历法的太史院、司天监，创制十二种天文观测器，又在全国分设廿七个观测站，和数学家王恂等人造《授时历》，测定和发现的恒星达二千五百多颗，可说是世界天文史上的重要学者。西域人札马鲁丁引入伊斯兰文化的天文历法，任职回回司天监，创制七件天文仪，是当时欧、亚最先进的仪器，如地球仪就改正了传统天圆地方的错误，他也编写出《万年历》（回回历）。

记述农业知识和技术的有《农桑辑要》，由官方编成的这部农书，总结元代以前北方农业经验和新增作物的栽培技术。王桢作《农书》，主要强调生产工具；畏吾儿人鲁明善作《农桑衣食撮要》，规划按月安排的农作活动，这些都很有实用特色。在医学方面素为元朝廷所重，中央设太医院，其下又设专管回回医药的广惠司，地方上普设医学学校（三皇庙学），医学应相当发达。中医学上有所谓金元四大家，在元代就有李杲、朱震亨两位名家，他们著有专门医学数种。另外有受学于名医张元素、李杲的王好古，他主张温养医药；窦默为儒士，他和滑寿都是针灸医家；长于外科的有齐德之和危亦林，尤其后者著书记录世界最早的全身麻醉药物，以及悬吊法复健脊椎等。西域人萨德弥实考定药方，有《瑞竹堂经验方》医书，流传至今；西域忽思慧任职饮膳太医，他以医方和食物编成食疗及营养学专著《饮膳正要》，是实用又有趣的中、西医食文化书籍，也流传至今可见。

元朝史书

《蒙古秘史》又称为《元朝秘史》，原书是已佚的畏吾儿体蒙古文写成，今所见的是明初翰林翻译员用汉字音写蒙古语，逐词句加旁注，并分段再节译的汉字蒙音本。它大约写成于蒙哥汗即位的第二年，记载成吉思汗之前第廿二代祖先开始，敍述蒙古各部、氏族的形成和发展；成吉思汗的创业及建立帝国；西向、南向的征服扩张；以及极少部分的窝阔台汗时代。这是蒙古早期历史最重要的史籍，其中还有关于制度、社会、文化、思想方面的内容，全书用口语白话的形式述事，读来像具有民族特色的民间文学作品。

吐蕃藏族公哥朵儿只在元末时写成《红册》全书，记印度、汉地古代史；蒙古元朝史；还有包括吐蕃历史及各族教派简史的西藏史。关于蒙元史部分，作者参考了宫廷密藏的蒙古史官记作。元朝采用中国的史官制度，不过除汉人史官外，又另设有蒙古史官。

宋、辽、金三史

元初元好问和王鹗都曾有意修金代史，并搜集、记作相关资料。蒙古朝廷采用传统的史官制度，修纂各朝实录，以及搜罗前代的修史资料，但修前代的宋、辽、金三史是在元末顺帝时才积极完成。当时对修三史的体例有不少争议，在监修宰相脱脱主持下，决定三史分别独立修成，又以三朝代各自为正统，这是有意义并实际的看法，而参与修史是集各族群共同的努力，也是修前朝代史这一传统的实践。

南宋遗民胡三省为《资治通鉴》作注释，他对这部通史名著作精细的考证和疏通，也将他的史观和遗民心思籍此表现。另一遗民马端临作《文献通考》，分门别类地编写典章制度通史，以各种史料的“文”和议论奏章的“献”来著述，同时也有考辩及表达意见。

地理志和地图

西域天文学家札马鲁丁建议忽必烈汗编纂全国的地理志，于是修成包含中国和西域地区的《大元大一统志》。志书有彩绘的全国总图和地方小图，非常讲究，但这一千三百卷的大部头书多散失不全，今天只有极少部可见。地方志留存很少，著名的如金陵、昆山、镇江、四明、南海等方志极有价值。地理上探寻黄河源是件大事，忽必烈汗命女真人都实西行探河源，后来潘昂霄根据探勘敍述作《河源志》。正一教道士朱思本亲去中南部、华北、华东各地代大汗祭山河，借此绘制长宽七尺的《舆地图》，用传统“计里画方”法绘出元朝全国地图，所标示的河源和今天的考查结果相同。

西域诗人迺贤，遍游河北、河南，作出附有古史、地考定的游记《河朔访古记》，惜今天残存甚少。从事海外贸易的商人汪大渊，将所见东南、西南亚、印度洋、东北非洲各地著作《岛夷志略》，但前面二条却记了澎湖、台湾（琉球）的中国领土。奉使到柬埔寨且居留一年多的周达观，他著《真腊风土记》，写吴哥盛世时代的风俗、生活文物等，是那个时期极难得的记载。越南人黎崱随军降元而入中国，著《安南志略》，是部越南的史志书，以及中越关系简史，也可说是自古到元朝时最早的一本越南史。