虽然中国民间博物馆发展取得较大的成绩和发挥了重要的作用，但是由于民间博物馆在中国还是一种新事物，尚处于探索阶段，还存在基础设施薄弱、管理运行不规范、与专业标准有较大差距、社会作用不明显等一系列问题。

首先，民间博物馆设立条件不完备，发展不够均衡，个体差异很大。目前不少民间博物馆存在藏品数量不多，馆舍功能欠齐备，专业人才不足，开放的常设展览、教育活动和社会服务品质不高，数量不够的问题。有限的场地空间严重限制了文物储藏、保护、展示、对外开放等工作。在民间博物馆中，只有少部分的综合实力可与国有博物馆比肩，而相当一部分民间博物馆还停留在“亮宝楼”、“古玩店”的原始形态上，博物馆的应有职能未得到充分发挥。由于发展过程中的这种失衡，影响了博物馆业整体水准的提升。

其次，民间博物馆法人治理结构不完善，营运保障机制不健全，模式单一，经费欠缺。健全的法人治理结构是民间博物馆长期健康有序发展的根本保证。民间博物馆虽然在申报阶段都从文本上组建了“理事会”、“董事会”、“监事会”等机构，但大都流于形式，“家族”、“团伙”式的管理状态没有从根本上得到解决。而中国民间博物馆多采取创办企业注资或创办者个人注资的办法保障营运问题，但由于投资大、回报小，存在严重的经费不足和难以维持发展的问题。博物馆馆舍维修、藏品购置和日常维护、管理人员薪酬等，都需要长期足够的资金支持。

目前中国民间博物馆获政府支持的力度和国有博物馆以及国外比较起来还存在相当差距。国内虽然有多项法律法规及政策扶持包括博物馆在内的公益文化事业，但因部分内容缺少可操作的执行细则，及受跨部门、跨行业的制约，最终导致政策应有的作用和效果未能充分发挥。

为了规范和促进民间博物馆的发展，以下几个方面需作出改善：

一、规范和完善民间博物馆的准入制度，逐渐均衡民间博物馆的发展。按照相关法律法规，完善民间博物馆的审批程序，将民间博物馆纳入政府管理。同时，一方面要按照优胜劣汰的市场规则，允许一小部分原始条件差，后续发展能力弱的博物馆自然退出；另一方面，对有影响、有特色、有发展潜力的博物馆，要在财政扶持、人才培养、专业指导等方面帮助他们走出困境，良性发展。另外，也要提高门槛，把营运保障能力作为“准入”的重要条件。

二、实现完善的法人治理结构，赋予民间博物馆与公立博物馆同等的法律地位。未来的民间博物馆将从组建高级别的基金运作，政府投资担保，社会化公益募捐，博物馆有形、无形资产评估，进而搭建融资通道等方面寻求突破；或建立博物馆行业基金会、利用像“文化遗产保护基金会”这些平台，以博物馆为试点，开展推行民间博物馆法人治理结构试点工作；并且赋予民间博物馆与公立博物馆同等的法律地位，在行业准入、等级评定、人员培训、职称评定，以及土地使用、税费减免、银行信贷、收缴文物划拨等方面与国有博物馆一视同仁，保护民间博物馆的合法权益。

三、制定和落实对民间博物馆的扶持政策，包括增加政府财政扶持、建立和完善社会公益保障机制。可考虑通过优惠政策引导和政府文化产业专项资金重点扶持的办法，帮助民间博物馆培育和发展文化产业项目；也可考虑整合全国博物馆资源优势，组建博物馆文化创意产业集团，为民间博物馆的可持续发展提供保障。