作为祭祀孔子的庙宇，孔庙深蕴特殊的文化意义。二千多年来，孔子儒学一直深受尊崇。西汉初年，汉高祖刘邦亲到曲阜祭祀孔子，汉武帝更独尊儒术，于是儒学便成为当年皇帝治理国家的主要理论依据。唐朝初年，除了国子监修建的孔子庙外，皇帝又下诏“州、县皆立孔子庙”，以后各代沿袭，于是孔庙成为中国分布最广的礼制庙宇。孔庙九进院落、黄瓦红墙、四方角楼、门钉、龙柱等均仿皇宫式样，体现了孔子的崇高地位。孔庙祭祀孔子，以历代的贤儒从祀，也说明了人们对孔子的重视和尊敬。曲阜孔庙已经不是孔氏家庙，而是国庙，成为尊孔的象征，成为历代中国人心目中的圣庙。

孔庙建筑众多，前后贯穿在一条中轴线上。这条长达一千余米的中轴线，便是孔庙的甬道。从南到北远远望去，甬道笔直幽深，加上对称排列的孔庙建筑，更显庄严肃穆。进入孔庙，沿着甬道前行，前后有九进院落，甬道上有不少门、坊、殿、阁，从前向后，依次是金声玉振坊、棂星门、太和元气坊、至圣庙坊、圣时门、弘道门、大中门、同文门、奎文阁、大成门、杏坛、大成殿、寝殿、圣迹殿。幽深的甬道似乎象征着孔子的深奥思想。

孔庙的门坊匾额名称各有寓意，或显示了孔子思想的价值，或体现了人们对孔子思想的景仰，如仰高门、观德门、毓粹门。除了门坊，孔庙中还有不少建筑，这些建筑的名称以及相关的匾额显示了孔子思想的博大精深。

孔庙建筑物上覆黄瓦，周边红墙，规格与皇宫相等，充分显示了历朝对孔子的尊崇。礼制思想是孔子和儒家思想的重要组成部分，孔庙也是典型的礼制建筑。孔子生前祖述尧舜、宪章文武，教授生徒、广育英才，删述六经、整理文献，到处奔走宣传学说，给中华民族留下了宝贵的文化遗产。后世崇儒，甚至尊孔子为“大成至圣文宣王”、“万世帝王之师”，祭祀孔子的庙宇有九进院，祭祀孔子用八佾舞，这都与孔庙的黄瓦红墙一致，是对孔子丰功伟绩的尊崇。