隋唐時期，以巢元方論述病因、症候的著作《諸病源侯論》為劃時代的著作；孫思邈的兩部千金方，是臨床醫術百科全書式的代表作；第一部國家藥典專著《新修本草》頒行全國，使醫學教育、中外醫學交流日趨繁盛。

孫思邈（公元581—682年）陝西耀縣人，從事醫療與研究八十餘年，總結編撰《備急千金要方》30卷，《千金翼方》30卷，對臨床各科醫療經驗、醫學理論、本草學做了系統的研究論述，尤其對糖尿病、缺乏營養疾病、痢疾、霍亂、結核病等的診斷與治療方面，有突出進步。此外，重視婦兒科、針灸發展、使用地道藥材和整理研究張仲景書，也多有創見。在養生健體方面，提倡動、靜功結合理論、嚴厲批評服石之風，更顯出他作為偉大醫學家的風采。他的兩部千金方被後世視為中國第一部臨床百科全書，影響甚巨。

孫思邈之才學與品德，在後世均有很高地位，如孫氏誕辰500周年所刻的宋碑，碑端刻有孫氏「坐虎針龍」畫像；逝世890周年時明代曾摘兩部千金方之寶要，刻立《千金寶要碑》，以實踐孫氏普救世人之願望。在孫氏誕辰1080年及逝世1100周年時均刻有清順治、乾隆時之紀念碑石。至今每年春、冬均有兩次廟會活動，以紀念他的誕辰等。

隋代巢元方奉敕集體撰成之《諸病源候論》，是中國繼《黃帝內經》後最權威的疾病病因及病機理論研究。巢元方，曾任太醫博士，陝西華陰人。《諸病源候論》共50卷，67門，對內、外、婦、兒、五官等1700多條證候、發病病因和病理機轉等，有深刻論述。所論病因頗多新見解及啟發，不但闡述了傳統風、寒、暑、濕、燥、火六淫等因素外，更對致病之蟲和傳染病因「乖戾之氣」的物體引起的感染病，作深刻分析，強調「預服藥及為方法以防之」。

《新修本草》正文20卷、藥圖25卷、目錄1卷，收藥884種，是唐高宗接受蘇敬上書，徵召醫藥學家與科學、藝術家、行政官員二十餘人，共同對前代本草的修訂，並「下詢眾議」，「定群言得失」，令全國郡縣上報地道藥材與繪圖，經兩年多時間，於公元659年完成，並由政府頒行全國，作為用藥之準繩，也是當時唐與日本醫學教育的重要教材。

《外臺秘要》是由王燾（公元670—755年）所著。他是陝西眉縣人，宰相門第出身，知識淵博，曾掌策唐代國家圖書館「弘文館」二十多年，因自身多病，非常愛熱醫學，勤奮攻讀醫書，並一一摘錄，撰成病症分類1104門的《外臺秘要》40卷，積累了非常豐富的醫療經驗，他在引用前代醫家的理論經驗時，都各註出處，是一位醫學文獻整理大師，其內容保存了許多已佚醫書的寶貴資料，文獻研究價值極高。