汉晋以来，齐云山就有外来宗教文化活动的踪迹。唐朝天宝元年（公元742年），齐云山西南部岐山石桥岩、万寿山一带始有佛教活动萌芽。明《徽州府志》和《齐云山志》载：“岐山有天然石桥，又称石门，壁立千尺，古藤络其上，花时如锦。石门寺因梦而建，置钟、鼓杂物具足。”僧本立，锐意佛门，率为一方香火胜地。至北宋，寺院颇具规模，香火兴盛。南宋后期，齐云山月华街一带道教香火逐渐兴起，佛教备受冷落，日趋消沉，为齐云山的道教兴盛揭开序幕。

皇家镇岳

齐云山开辟为道教名山皇家镇岳，始于南宋宝庆年间（1225至1227年），方士余道元自黟北（黄山）游至齐云山天门岩，得潜师天谷子印石“宜我室此”，筹资兴建佑圣真武祠于玉屏峰下。相传真武大帝神像由百鸟衔泥塑立而成，昭世灵验，崇拜道教的居士信徒，纷纷解囊，献地输财，筑祠建观，香火日盛，道士渐增，奠定了道教基础。明代以来，齐云山道教日趋兴盛，四方来祷者，络绎不绝。明弘治、正德年间，齐云观道士汪泰元、方琼真等又大举兴工修建了道德岩、圆通岩等，在紫霄崖建有玉虚宫、天乙真庆宫、治世仁威宫，在桃花涧建净乐宫，在月华街建榔梅庵等，又于华林坞种植果树数百株，凿塘垦田，作为道士住持生活及祭祀香火之资。

明嘉靖、万历年间，齐云山真武道场进入鼎盛阶段。嘉靖十一年（1532年）登基多年未得皇嗣的明世宗降旨求嗣，旨意称齐云山乃北极真神之福地，特遣妙应真人李得晟，恭诣神祠下，修建“金箓祈恩求嗣继绪保国大斋”七昼夜。次年果然诞生皇子，且一发不可收，数年中又相继诞生数位皇子。明世宗因此龙心大悦，对齐云山真武神的灵应深信不疑。嘉靖十七年（1538年）六月，又遣第四十八代天师正一大真人张彦頨，前往齐云山北极佑圣真君神祠下，启建金箓大斋，酬谢神灵“锡嗣继统”之恩。同月还启建“金箓祈恩保母安疾永寿延禧大斋”，为太后祈福。又设玉箓大斋，祈求神灵消除皇帝疮疾。至此，齐云山真武道场升格，成为列入国家祀典的场所。其主体建筑齐云观更名为“玄天太素宫”，受皇上敕旨保护，并获得免税特权。嘉靖二十年（1541年）九月，又因张彦頨奏请，礼部奉旨：道士朱宗相准授太常寺寺丞兼本宫事，汪曦和除授提点，铸降印记，公同管理道众，晨夕焚修。

道教法事

齐云山做道场主要根据事主要求设定祈禳仪式，俗名“做事业”。在道场中担任较高职务的称为“都讲”、“高功”，必须熟悉经咒的念唱、吟表、禹步等动作，以及锣、鼓、扳鼓、钹、笙、笛等乐器的演奏。齐云山道场2010年被列入安徽省级非物质文化遗产名录。道场因事主的要求不同，其内容、形式与名称亦各有殊异，如祈福、禳灾、求平安以及超渡亡魂等。做道场时，道士着法衣道袍、抱笏登场，操婺源乡音，诵经念咒，悠扬悦耳，别有腔调。

规模最大、时间最长的道场称“罗天大醮”，此法事专为秉承帝王赦命，或沙场为国捐躯以及天灾大难中牺牲者超渡亡灵而举办，此类为期七昼夜以上之法事，平常尚属少见。通常各大村族祠，每年一度的中元节（农历七月十五）多有“放焰口”法事活动，水陆道场，一夜之需，费用不菲。一般中小型斋醮，多在香客逗留的道房或宫观举行。

道教音乐

道教音乐的来历，据史料记载：“陈思王游鱼山，闻岩里有诵经之声，清远嘹亮，因使解音者写之，为神仙之声。道士效之作步虚声。”道教音乐主要用于道士们诵经、赞礼及各种祭祀、斋醮活动，所以又称“道场音乐”、“法事音乐”。道场法事，必须锣鼓乐器配合以增加其庄严、强烈的气氛。尽管几经磨难，齐云山道经乐谱多有流失，但齐云山道教协会成立后几经努力，多方收集及据老道士回忆，加以整理，现仍保存大部分。齐云山道乐采用原始老谱“工尺谱”曲调（工、尺、上、乙、是）演奏，具有优美怡淡、缥缈飞翔的韵律。目前演奏的主要曲牌名有《步虚韵（高步虚、绕坛三步虚）》、《驻云飞》、《真香初炷》、《大开门》、《颁赦》、《送饭》等。2008年6月，齐云山道场音乐被列入国家级非物质文化遗产名录。2011年，齐云山道乐表演艺术团成立并经常有演出活动。

香会

香会是八方四邻的善男信女朝圣齐云山的一种群众活动。齐云山香会一般从农历七月初一开始，至十月初一结束。每年初秋，各道房即派人分赴各县乡邀约老主顾，山上则整洁房舍，清扫道路，做好迎接香客登山准备。农历七月初一，由道长为首，率各院房道众大斋之日，并在玄天太素宫做大型“禳星”道场，祈求玄天大帝保佑香火平安，道业兴旺。十五日为中元节，俗称“祭鬼日”。各院房道士，汇聚太素宫，为那些孤魂野鬼做水陆超渡道场。七月十五以后，浙江省淳安、开化、江西省婺源以及徽州各县的各路香客和香会团体组织，依照固定吉日起程进香，如“曾元会”、“三多会”都在七月十九日；“礼敬会”定于九月初一；“诚敬会”为九月十六日。高潮则是九月初九“重阳会”（即玄天上帝登极之日），永安“百子会”以及各乡有名望的百子香会，都不约而同地在这天进香，零散的香客信士也很多，热闹喧哗，盛况空前。