殷墟的中心是宫殿区和王陵区。宫殿区在洹河南的小屯、花园庄两村及其周围。1958—1959年，在小屯村西约二百米进行考古钻探，发现一条南北向的大壕沟，1986年再次钻探，基本弄清了它的形状和走向。此沟北接洹河，南至花园庄西南角即东折，一直向东延伸到洹河内。而洹水自西向东流，到小屯北即折而南行，宫殿区即在这河湾内的高地上。当时由洹河和壕沟把商王及王室成员的居住区与其他地区分开，并起到防卫作用。

殷商的宫殿建筑，平面呈长方形、方形、凹字形、凸字形等多种，以长方形最为普遍，门以朝南为主，也有朝东的。殷商时期的宫殿通常都是高台建筑，即宫室坐落在一整片夯土台基上。往往是建筑面积愈大，台基愈高。高台建筑的目的，在于防潮和通风，达到高爽明亮的效果。由于宫殿较高大，对于承重的柱、础亦较讲究。

殷墟宫殿建筑，多为“四阿”式的顶，即屋顶是四面坡式。宫殿的屋簷，有的是单簷，亦有重簷，后者古文献上称之为“四阿重屋”，“重屋”增加了屋面的出簷深度，保护了墙体、防雨、防晒、保证良好的采光、通风条件，又避免了屋盖过于硕大有损宫殿高耸形体的缺陷，这是中国古代建筑史上一个成功的创造。这项建筑技术，成为以后三千余年主体殿堂建筑的定制。当时宫殿的屋顶上还铺上茅草，保温隔热。现今在殷墟博物馆内，在原乙二十基址上，根据古建筑学家杨鸿勋的设计，复原了一座“四阿重屋、茅茨土阶”的宫殿，气势雄伟、巍峨壮观。

在殷墟宫殿区以外，于小屯西地、大司空村、孝民屯、苗圃北地、徐家桥等地都发现过建筑形式及建筑规模不同的居住址。按其形式，可分为三类：

第一类是地面房屋。房屋有的直接建在地面上，有些房屋的地基是先挖基槽，再填土夯打的。2004年，在北徐家桥村发现了一处规模较大的商代四合院式的夯土建筑群，就是这种较讲究的地面建筑的代表。

第二类是半地穴式的房屋。建筑时直接在生土中开挖坑穴，以坑壁作为屋墙的下部，再于其上培土加高，到一定高度时，架设木椽，用茅草或树枝盖顶。

第三类是地穴式的房屋。面积大多在几平方米至十几平方米之间。这类房子，都是从地面往下挖出坑穴，坑的深度多在2－3米之间，个别可深达6米。坑壁平整，坑的底部是居住面，坚硬而平整，有的还用火烧过，顶部用树木枝干和茅草（或再加上泥）封盖。此类房屋，从坑底至坑口，大多有斜坡或阶梯式的台阶作为上下通道。

当时的中小贵族，居住于面积较大的夯土筑造的房屋中，普通平民生活于面积较小的地上或半地穴房屋里，而处于最底层的奴隶以潮湿狭小的地穴作为栖身之所。