黄山峰林如海，沟壑纵横，雨量丰富，夏秋季气候凉爽，适宜动植物生长。由于山顶、山腰和山脚分处寒带、温带和亚热带，随海拔高度的垂直分布，各个气候带的动植物均可生长，而且种类繁多，使黄山成了一座生物宝库，名花嘉木，珍禽异兽，应有尽有。黄山共有一千五百多种植物，其中树木占了三分之一，而动物则有五百多种（其中鸟类有一百七十多种，脊椎动物占三百多种）。因此，黄山在中国的动植物的研究中占有重要一席，故黄山又有 “华东动植物宝库”之称。

珍禽

黄山鸟类中，以八音鸟和白鹇最为珍贵。八音鸟，又称“山乐鸟”、“音乐鸟”。牠体形秀美娇小，背苍，腹黄，毛色秀丽。每日凌晨四五点钟开始鸣叫，叫声很长，一声能发八个音。音色清脆悦耳，旋律婉转优美。白鹇，又名“白山雉”、“白凤凰”。牠一身羽毛雪白，上体与两翅有少许“V”形黑色斑纹，尾羽很长，面部和脚呈红色，嘴绿色，体态端正，行止闲静。黄山人工饲养白鹇的历史已很久远。唐代李白游黄山时，曾写《赠黄山胡公求白鹇》一诗，换取当地高士胡晖饲养的一对白鹇。因白鹇久经驯养，呼之便能依掌就食，十分可爱。

异兽

黄山兽类中，短尾猴是最奇异的一种。牠因尾短（ 约2寸）而得名，身材高大，四肢粗壮，身披灰褐色长毛，能直立行走。短尾猴群居于1,000米左右的高山丛林中，冬季向下迁移。胆子大，见着游人直眨眼睛，不时做着各种调皮、滑稽的动作，只要人们不触犯牠，便可相安无事。黄山短尾猴有能酿酒的趣闻。牠们春夏采杂花野果储藏于石洼之中，在一定温度下便自然发酵成酒，是一种“无心插柳柳成荫”的现象。短尾猴吃了石洞中已发酵的狝猴桃，经常醉倒，甚为有趣。

古木

黄山分布着丰富多彩的森林植物群落，而且还保存着很多的古树名木。如银杏，俗称“白果树”，是第四纪冰川时代遗留下来的古老珍稀树种。黄山古银杏，树龄多是数百年，甚至千年。它树姿优美，叶形如扇，微风吹拂，枝摇扇舞，深秋季节满树金果，是著名的观赏树种。鹅掌楸也是古时遗下的树种。树干巍峨挺拔，树冠宛如伞盖，叶形奇特，春末夏初枝端长满黄色花朵，分外娇美，是世界上珍贵的观赏树种，它不仅树种古老，而且树龄往往达数百年。

奇花

黄山的高峰深壑之中，生长着珍稀的奇花异草。如“天女花”，为落叶小乔木，春季在绿荫丛中时出点银花，在轻风抚摇下频频摆动，花瓣散落于微风荡漾之中，恰似天女散花，“天女花”之名由此而来。又如黄山杜鹃，为常绿灌木，叶卵状披针形，花冠呈钟状，白色至淡紫色，密布枝顶，遮着枝叶，富丽饱满，令人心醉。在西海杜鹃坞和北海散花坞，数十数百棵杜鹃花连成一片，远眺似云、似霞、似锦。此外，黄山异草，以龙须草、云雾草、还魂草为着。黄山民谣称：“黄山草中有三宝，龙须、云雾、还魂草。”它们均具药用价值。