商代滅亡之後，繁華的都城逐漸變成廢墟。西周時期，現安陽一帶屬衞，春秋時期先屬衞，後屬魏，秦昭襄王十五年（公元前257年）攻取該地，才始名「安陽」。

漢初，廢除安陽之名，以其地屬湯陰縣。隋開皇十年（公元590年）置安陽縣，屬相州。金代明昌三年（1192年）升相州為彰德府之府治，安陽屬彰德府。元朝至元三年（1265年）改為彰德路，明朝洪武二年（1368年）恢復府。

殷墟的腹地小屯，自隋唐至明代中葉時期是墓地，荒墳壘壘。到明萬曆期間，才有人居住，建立了小屯村。明清時期，這裏只是一個很普通的村落，自發現甲骨文之後，由於收藏家和金石學者不惜重金搜求，出售甲骨成為有利可圖之事而引起當地村民猖狂盜掘。據統計，從1899—1928年，私人挖掘出土的甲骨達十萬片左右。由於村民私掘，只揀有字甲骨賣錢，對甲骨埋藏狀況及與甲骨同出的陶、石、骨等其他遺物全然不顧，使殷墟遺址遭到嚴重破壞。為了制止這種盜掘現象，為了獲得更多的甲骨文及與甲骨共同出土的其他遺物，以便更好地研究商代歷史，必需要對殷墟進行發掘。所以，發掘殷墟，在二十世紀二十年代後期，成為當時有識之士的共同心願。

當時，中國也具備了發掘殷墟的條件，自北宋以來傳統的金石學得到發展，對古文字的釋讀，對古器物年代的考訂水平也日益提高，這為近代考古學誕生打下了基礎，而且那時西方國家的地質學傳入中國，對近代考古學的產生也起了積極的影響。在二十世紀二十年代，中國的考古工作興盛起來，仰韶遺址、周口店北京猿人遺址等發掘獲得了不少經驗。於是到1928年秋，殷墟發掘工作便開始了。

自發現甲骨文和殷墟考古發掘開展以來，這裏逐漸名揚中外。1958年中國科學院考古研究所成立了安陽考古工作隊，1959年在小屯村西修建了考古工作站，長年在此進行考古工作。1961年殷墟被國務院列為第一批全國重點文物保護單位。2006年7月，第30屆聯合國世界遺產大會通過，將殷墟列入世界文化遺產名錄。現在殷墟的遺跡、遺物得到了很好的保護，它厚重神秘的青銅文化吸引着愈來愈多的中外學者及旅遊人士前來探訪。