澳門開埠後不久，明朝官員制定了一系列政策來管理澳門。

由於澳門位於廣東香山縣，也是一座貿易港口，處理澳門事務涉及多位官員，包括廣東布政使、按察使、廣州市舶司提舉、海道副使、香山知縣等，而他們之下設有「守澳官」。據《澳門記略》中所述，明代曾經設有「提調」、「備倭」和「巡緝」的守澳官，屬於沒有品級的地方小吏，但他們是最早接觸葡萄牙人的中國官員。

1574年（萬曆二年），香山縣在連接香山與澳門之間的「蓮花莖」上建造關閘門，並且派出官兵駐守，一方面震懾葡萄牙人，另一方面控制往來澳門的物資和供給。為了加強兵力，明朝於1621年（天啟元年）在關閘附近設立前山寨，並且派駐重兵鎮守。

除了設置官員和派駐軍隊之外，海道副使俞安性針對居澳葡人制訂《海道禁約》，一共五款禁令，成為中國頒佈管制澳門最早的法令。

十八世紀的澳門華洋雜處，華洋之間衝突和糾紛時有發生，如1740年代就發生了兩件華人被葡人殺害的案件，促使清朝重新審視對澳門的管理。

1743年（乾隆八年）華人陳輝千被殺案後，兩廣總督策楞提出設立澳門同知（正五品），並把香山縣丞（正八品）移到望廈村，與香山知縣共同處理澳門事務。澳門同知衙署（軍民府）置在前山寨，一方面負責番禺、東莞、順德和香山的海防，同時亦管理澳門的葡萄牙人。香山縣丞則是管轄澳門葡萄牙人事務的官員，並與葡萄牙人的議事會聯絡。

澳門同知印光任在1744年（乾隆九年）上任後，隨即制定《管理蕃舶及寄居澳門夷人規約》，合共七款。1748年（乾隆十三年），澳門又發生兩名華人被葡萄牙士兵殺害的事件，澳門同知張汝霖在1749年（乾隆十四年）頒佈《澳夷善後事宜條議》，共十二款，並以中葡兩文刻在石碑上，中文石碑立在香山縣丞衙署，而葡文石碑則置在議事亭內。

1583年（萬曆十一年），居澳葡人在澳門主教薩（D. Leonardo de Sá）的提議下成立議事會，作為葡人社區的自治機構。議事會成員由葡萄牙人選舉產生，並獲得葡印總督（葡萄牙王室代表）同意方能上任。議事會一直是管理澳門葡萄牙人的主要機構，而成員之一的「理事官」（Procurador）負責與清朝官員聯絡，以便執行官員的命令和進行商議。

1623年（天啟三年），葡印總督派駐「澳門總督」（Governador de Macau）到澳門，一方面負責城市防務，另一方面代表葡萄牙王室管理澳門。因此，議事會與澳門總督多次發生衝突，包括在執行清朝的命令上。結果，葡萄牙政府在1783年發佈一系列命令（《王室制誥》），加強澳門總督的權力。儘管議事會提出反對，但依然無法改變情況，而在1844年（道光二十四年）澳門省政府成立後，議事會漸漸成為澳門市政機構，直到1999年回歸為止。