《山海经》记载了古代华夏疆域内外各地风土物产，无所不包，可谓后世博物学的鼻祖。当中包括百多个邦国、五百多座山、三百多条水道、百余种金属和矿物，还有动物、植物各二百余种，畏兽几百种，其中动物有虎、豹、熊、罴、狕、猩、犀、禺、羚、象、猥、訾、驼、白蛇、猼𫍙、毕方、何罗鱼、狌狌等。书中的物产记载主要在华夏部分的“五臧山经”。
记载大量中国物产
据统计《山海经》记载有鸟56种、兽89种、鱼37种、虫11种、草30种、木28种等。有走兽，如马，“湖灌之山，其阳多玉，其阴多碧，多马。”有能飞的飞鼠，“有兽焉，其状如兔而鼠首，以其背飞，其名曰飞鼠。”有飞禽，“县雍之山，……其鸟多白翟白䳑”。水族多，有鱼类，“嚣水出焉，而西流注于海，其中多鳛鳛之鱼。”有两栖类，“藟山，……湖水出焉，东流注于食水，其中多活师。”活师即蝌蚪。有爬行类，“怪水出焉，而东流注于宪翼之水。其中多玄龟。”有介壳类，“激水出焉，而东流注于娶檀之水，其中多茈羸。”即紫色螺，也有人认为茈蠃是一种紫色的草。书中描写很多白色的动物，不排除是白化严重：“英鞮之山，上多漆木，下多金玉，鸟兽尽白。”
书中亦记载动物的鸣叫声，“有兽焉，其状如白犬而黑头，见人则飞，其名曰天马，其鸣自䚯。有鸟焉，其状如乌，首白而身青、足黄，是名曰鶌鶋。其名自詨。”所谓天马、鶌鶋就是它们呼叫自己的名字。此类文字记载了那时的生态和动物，是宝贵的资料。如众兽之山有大量的犀、兕，现在中国境内野生犀牛早已全部消失。书中还描写鹦鹉能言，认为它有跟人一样的舌头：“有鸟焉，其状如鸮，青羽赤喙，人舌能言，名曰鹦鹉。”
植物则有樗柏、韭韭、荆杞、葱韭、漆、桐椐、松柏、榛楛、棕、梓桐、桃李、菌浦（草）等。“景山，……其草多秦椒。”秦椒即花椒。竹子的记载亦不少，说明当时竹子分布广泛，竹文化也源远流长。“牡山，其上多文石，其下多竹箭、竹䉋。”“京山，有美玉，多漆木，多竹。”“轩辕之山，其上多铜，其下多竹。”《山海经》大量记载漆树的生长资料，“英鞮之山，上多漆木。”不难理解为何中国古代的漆器工艺技术那么发达和精湛。
地质矿产类方面亦有不少记载，如金属有金、白金、银、赤银、铁、磁铁、铜、锡、赤锡、白锡等，分类十分细致。非金属有玉石、碧、青碧、瑶碧、雄黄、青雄黄、玄䃤、砥励、美赭、磁石、黄垩、涅石等。全书玉字有183处。黄金有16处，银有10处，铜有17处、铁有19处。玉的称呼很多，如玉、水玉、白玉、苍玉、藻玉、美玉、㻬琈之玉等，还有泛称的珠玉。铜的称呼有铜、赤铜、赤金等：“小次之山，其上多白玉，其下多赤铜。”在书中称黄金也会单称为“金”，“其阳多玉，其阴多金。”其他矿物，如“其下多砆石”砆石即类似玉的石头。
《山海经》所载金属中以铁的次数最多，说明当时已有冶铁技术。早在商代，人们已懂得利用天然陨铁，经锻造后用于制作兵器的刃部，但春秋时期才真正懂得人工冶铁来制造兵器。据统计《山海经》中出产铁之山，以秦地居多，还有赵、魏、韩、楚，但并无齐及燕国的产铁资料。推断此书完成于秦取得楚、韩、赵、魏、周、蜀国的图籍之后，秦王朝的巫史将这些新领土上的矿产信息写于书内。
有关地貌与水系的描写，如“帝都之山，广员百里”记载了山的规模。“泰冒之山，……洛水出焉，东流注于河”、“长沙之山。泚水出焉，北流注于泑水”、“时山，……逐水出焉，北海注于渭”、“高是之山，滋水出焉，而南流注于虖沱。”都记载了山脉和水系。
综合记载的物产
《山海经》内有综合介绍中国的地貌及物产，如“鸟危之山，其阳多馨石，其阴多檀楮，其中多女床。鸟危之水出焉，西流注于赤水，其中多丹粟。”综合记载鸟危山的地貌与物产，介绍了水系、矿物馨石、丹粟及草木檀楮等。再如“数历之山，其上多黄金，其下多银，其木多杻橿，其鸟多鹦鹉。楚水出焉，而南流注于渭，其中多珠。”此山有金属黄金、银，有树木杻橿，有鸟类鹦鹉，还有水中的特产珠，以及水系介绍。“高山，其上多银，其下多青碧、雄黄，其木多棕，其草多竹。泾水出焉，而东流注于渭，其中多磬石、青碧。”记载山中的金属银、矿物雄黄、磬石、青碧，植物棕、竹以及水系泾水从此发源，流入渭水。
若物产太多，书中则用“无不有”笼统概括：“积石之山，其下有石门，河水冒以西流，是山也，万物无不有焉。”书中亦有描写物产的医学功能及用法：“有鸟焉，其状如鹑，黑文而赤翁，名曰栎，食之已痔。”“有兽焉，其状如狗，名曰谿边，席其皮者不蛊。”还有独特地貌如无草木、无水：“饶山，是无草木，多瑶碧。”“其阳有金玉，其阴有铁而无水。”
华夏核心区域
“五臧山经”记载物产最详细，反映这些地方是华夏核心区域。记载矿产、动物、植物、水系、地貌等，尤其金属及其他矿产记载最为仔细，而略于族群及神话；“海经”、“荒经”则详于记载族群及神话，略于地理物产。例如全书19处记载铁，“五臧山经”占17处，“海经”和“荒经”合共只占2处，同时大部分神话都写在“海经”和“荒经”。这说明，愈近的地方愈清晰，愈远的地方愈神秘。
《山海经》对遥远的西部相对比较了解。〈大荒西经〉：“西有王母之山，壑山、海山。有沃之国，沃民是处。沃之野，凤鸟之卵是食，甘露是饮。凡其所欲，其味尽存。爰有甘华、甘柤、白柳、视肉、三骓、琁瑰、瑶碧、白木、琅玕、白丹、青丹，多银铁。鸾鸟自歌，凤鸟自舞，爰有百兽，相群是处，是谓沃之野。”此则地理、民族、风俗、物产的记载很详尽，包括“海经”里罕见的一处铁的记载，另一处在最终篇的〈海内经〉，两处同在西方，可见遥远的西部，因为有周穆天子的西征，成为足践之地，从而记载得比较清晰。
