高昌回鶻與喀喇汗王朝的回鶻人，大部分與周圍民族長期融合，形成了今天的維吾爾族。甘州回鶻在河西走廊與周圍民族相融合，形成了今天的裕固族。漠北回紇距今已一千多年，成為歷史，但在今天的維吾爾、裕固族中間，不論在種族或文化方面，都可依稀看見回紇文化的遺痕。古回紇人的語言屬突厥語，現今維吾爾語亦屬阿爾泰語系突厥語族。古時的回紇人曾信奉薩滿教，而在1949年以前，個別維吾爾族農村還可以看到薩滿巫師在民間作法治病。

裕固族的誕生

甘州回鶻滅亡後，各部落四散，有些依附吐蕃，有些投奔北宋，其中有一支退居沙州（今甘肅敦煌）以南，稱作「沙州回鶻」（敦煌古稱沙州）。據《金史》記載，沙州回鶻曾於1127年向金朝朝貢，但自此以後，沙州回鶻便從史書上消失了。十一世紀末，在《宋史》出現了「黃頭回紇」的記載，不少史學家認為黃頭回紇就是先前的沙州回鶻。

其後黃頭回紇又被稱作「撒里畏兀兒」（撒里在突厥語中是「黃」的意思；畏兀兒則是回鶻的另一種譯音）。十三世紀成吉思汗的蒙古大軍滅西夏，進入河西走廊，撒里畏兀兒便歸附蒙古。撒里畏兀兒在元朝後期，居地擴展到甘州和肅州（今甘肅酒泉）。

明朝建立後，撒里畏兀兒受明朝統治。十六世紀初，明朝將撒里畏兀兒東遷入關（嘉峪關）。此後二三百年間，操古突厥語的撒里畏兀兒人逐漸跟操古蒙古語的蒙古人相互融合，形成了自稱「堯呼爾」的裕固族。在民族形成過程中，一部分人使用古突厥語（西部裕固語），一部分人保留着古蒙古語（東部裕固語），還有相當多的人通用漢語。這就形成了今天裕固族使用多種語言的狀況。

維吾爾族的形成

維吾爾族主要分佈在新疆維吾爾自治區，據2010年人口普查統計，共有10,069,346人。維吾爾族主要聚居在天山以南的南疆地區，其中和田、喀什、阿克蘇、吐魯番和哈密五地區的維吾爾族人口，佔新疆維吾爾族人口的90％左右。維吾爾族信仰伊斯蘭教。維吾爾語屬阿爾泰語系突厥語族西匈語支。

回紇汗國瓦解後，回紇人大部分分三支西遷，其中一支是遷到河西走廊的甘州回鶻；一支是遷到今吐魯番盆地一帶的高昌回鶻（亦稱西州回鶻）；最後一支是遷到天山西部的帕米爾高原（古代稱蔥嶺）一帶，史稱蔥嶺西回鶻。其後，高昌回鶻人和部分蔥嶺西回鶻人與新疆南部的原有部族、操突厥語的鐵勒西支部族、漢人、羌人、吐蕃人，以及後來遷徙來的契丹人、蒙古人等長期融合，在共同信仰伊斯蘭教的基礎上，於十六世紀初形成了現代維吾爾族。